Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA2O43364 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms