Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN3O15551 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN3O15551 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms