Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SYNJ2O15056 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
SYNJ2O15056 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ2O15056 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms