Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF6O14896 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF6O14896 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF6O14896 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF6O14896 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF6O14896 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
IRF6O14896 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF6O14896 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF6O14896 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF6O14896 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF6O14896 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF6O14896 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF6O14896 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF6O14896 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF6O14896 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF6O14896 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF6O14896 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF6O14896 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF6O14896 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF6O14896 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF6O14896 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF6O14896 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF6O14896 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRF6O14896 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF6O14896 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF6O14896 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRF6O14896 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IRF6O14896 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF6O14896 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRF6O14896 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF6O14896 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF6O14896 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF6O14896 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF6O14896 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF6O14896 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF6O14896 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF6O14896 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF6O14896 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF6O14896 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF6O14896 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF6O14896 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF6O14896 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF6O14896 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF6O14896 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF6O14896 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF6O14896 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF6O14896 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF6O14896 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF6O14896 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF6O14896 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF6O14896 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF6O14896 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF6O14896 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF6O14896 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF6O14896 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms