Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNDC9O14530 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms