Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME4O00746 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME4O00746 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME4O00746 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME4O00746 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME4O00746 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME4O00746 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME4O00746 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME4O00746 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME4O00746 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME4O00746 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME4O00746 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NME4O00746 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME4O00746 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME4O00746 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME4O00746 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME4O00746 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME4O00746 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME4O00746 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NME4O00746 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME4O00746 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME4O00746 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME4O00746 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME4O00746 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME4O00746 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME4O00746 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME4O00746 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME4O00746 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME4O00746 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME4O00746 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME4O00746 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME4O00746 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME4O00746 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME4O00746 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME4O00746 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME4O00746 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME4O00746 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME4O00746 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME4O00746 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME4O00746 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME4O00746 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME4O00746 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME4O00746 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME4O00746 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME4O00746 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NME4O00746 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME4O00746 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME4O00746 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NME4O00746 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME4O00746 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME4O00746 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME4O00746 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NME4O00746 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME4O00746 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME4O00746 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME4O00746 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms