Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP6CO00743 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP6CO00743 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms