Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F3O00716 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F3O00716 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F3O00716 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F3O00716 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F3O00716 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F3O00716 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F3O00716 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F3O00716 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F3O00716 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F3O00716 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F3O00716 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F3O00716 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
E2F3O00716 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
E2F3O00716 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F3O00716 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F3O00716 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F3O00716 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F3O00716 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F3O00716 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F3O00716 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F3O00716 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F3O00716 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F3O00716 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F3O00716 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F3O00716 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F3O00716 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F3O00716 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F3O00716 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F3O00716 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F3O00716 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F3O00716 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F3O00716 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F3O00716 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F3O00716 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F3O00716 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F3O00716 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F3O00716 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F3O00716 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F3O00716 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F3O00716 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F3O00716 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F3O00716 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F3O00716 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F3O00716 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F3O00716 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F3O00716 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F3O00716 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F3O00716 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F3O00716 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F3O00716 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms