Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 AXL-205ENST00000599659 1708 ntTSL 1 (best)20.58■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.443e-13■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 CHERP-205ENST00000551747 886 ntTSL 212.17□□□□□ -0.463e-13■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.673e-13■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 VPS35-202ENST00000561713 589 ntTSL 419.15■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 VPS35-210ENST00000568784 4017 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 VPS35-211ENST00000569950 1096 ntTSL 59.82□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 VPS35-205ENST00000563984 775 ntTSL 26.13□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 VPS35-208ENST00000568612 697 ntTSL 53.77□□□□□ -1.812e-9■■■■■ 46.6
DDX3XO00571 CHST10-210ENST00000484382 519 ntTSL 318.51■□□□□ 0.551e-12■■■■■ 46.5
DDX3XO00571 SLC20A2-214ENST00000524237 545 ntTSL 416.45■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 46.5
DDX3XO00571 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.157e-8■■■■■ 46.5
DDX3XO00571 BRCA2-204ENST00000530893 2011 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.597e-10■■■■■ 46.5
DDX3XO00571 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.717e-10■■■■■ 46.5
DDX3XO00571 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.757e-10■■■■■ 46.5
DDX3XO00571 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-12■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.432e-12■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.47e-18■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 PDE6D-205ENST00000486044 1005 ntTSL 215.91■□□□□ 0.147e-18■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.17e-18■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 PDE6D-204ENST00000477748 996 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.097e-18■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 PDE6D-203ENST00000428104 627 ntTSL 313.6□□□□□ -0.237e-18■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.562e-14■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.657e-23■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.67e-23■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 YKT6-204ENST00000447123 1085 ntTSL 517.85■□□□□ 0.457e-23■■■■■ 46.4
DDX3XO00571 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.877e-17■■■■■ 46.3
DDX3XO00571 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.759e-40■■■■■ 46.3
DDX3XO00571 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.599e-40■■■■■ 46.3
DDX3XO00571 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.329e-40■■■■■ 46.3
DDX3XO00571 SLC25A36-206ENST00000502756 796 ntTSL 224.21■■□□□ 1.473e-19■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 SLC25A36-202ENST00000393015 659 ntTSL 519.87■□□□□ 0.773e-19■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 SLC25A36-214ENST00000515813 738 ntTSL 218.4■□□□□ 0.543e-19■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 SLC25A36-205ENST00000502594 1163 ntTSL 1 (best)17.88■□□□□ 0.453e-19■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.243e-19■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.223e-19■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.113e-19■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-19■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TMEM33-201ENST00000264452 1570 ntTSL 1 (best)21.29■■□□□ 11e-11■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-11■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-11■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TMEM33-205ENST00000508448 867 ntTSL 510.88□□□□□ -0.671e-11■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-11■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.022e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.12e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ELMOD2-204ENST00000503541 1839 ntTSL 227.24■■□□□ 1.953e-13■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 E4F1-202ENST00000562589 817 ntTSL 525.89■■□□□ 1.742e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ELMOD2-205ENST00000507667 594 ntTSL 425.59■■□□□ 1.693e-13■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TM2D3-209ENST00000560013 1868 ntTSL 225.33■■□□□ 1.656e-12■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.551e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.511e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.481e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-207ENST00000469716 573 ntTSL 324.21■■□□□ 1.471e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-212ENST00000490778 694 ntTSL 524.08■■□□□ 1.451e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-204ENST00000455123 1515 ntTSL 1 (best)23.96■■□□□ 1.431e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 MAP4K2-207ENST00000444560 469 ntTSL 523.96■■□□□ 1.432e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TM2D3-205ENST00000558677 878 ntTSL 523.92■■□□□ 1.426e-12■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.412e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.212e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.192e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-209ENST00000471883 451 ntTSL 322.45■■□□□ 1.181e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.142e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZNF181-205ENST00000593781 498 ntTSL 321.67■■□□□ 1.062e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-208ENST00000469926 645 ntTSL 321.41■■□□□ 1.021e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TCTA-202ENST00000482193 590 ntTSL 421.35■■□□□ 1.012e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 MAP4K2-206ENST00000439069 947 ntTSL 321.3■■□□□ 12e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.992e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 MAP4K2-204ENST00000433890 2410 ntTSL 520.78■□□□□ 0.922e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 LINC00094-202ENST00000550853 1068 ntTSL 220.52■□□□□ 0.882e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TCTA-206ENST00000497786 587 ntTSL 419.93■□□□□ 0.782e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 E4F1-207ENST00000565413 940 ntTSL 319.8■□□□□ 0.762e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TCTA-203ENST00000487432 892 ntTSL 219.29■□□□□ 0.682e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.632e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZNF181-207ENST00000599244 499 ntTSL 318.85■□□□□ 0.612e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TCTA-204ENST00000488385 800 ntTSL 218.78■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TCTA-205ENST00000493381 1081 ntTSL 318.16■□□□□ 0.52e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.486e-12■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-214ENST00000493290 550 ntTSL 417.71■□□□□ 0.431e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-215ENST00000493469 579 ntTSL 217.71■□□□□ 0.431e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 MAP4K2-209ENST00000468062 818 ntTSL 517.57■□□□□ 0.42e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.42e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TM2D3-213ENST00000560910 554 ntTSL 217.23■□□□□ 0.356e-12■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-213ENST00000491069 566 ntTSL 217.02■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 MAP4K2-205ENST00000435926 3169 ntTSL 516.55■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.136e-12■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZNF181-202ENST00000448715 3589 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZNF485-204ENST00000480678 532 ntTSL 415.33■□□□□ 0.042e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZBTB17-210ENST00000479282 1054 ntTSL 214.25□□□□□ -0.132e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 46.2
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