RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484382.5

CHST10-210, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 10, humanhuman

TSL 3

Gene CHST10, Length 519 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST10-210ENST00000484382 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.09■■■■■ 4.97
CHST10-210ENST00000484382 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.41■■■■■ 4.22
CHST10-210ENST00000484382 ABCC9O60706 1549 aa41.24■■■■■ 4.19
CHST10-210ENST00000484382 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.39■■■■□ 3.9
CHST10-210ENST00000484382 NACADO15069 1562 aa39.13■■■■□ 3.85
CHST10-210ENST00000484382 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.94■■■■□ 3.82
CHST10-210ENST00000484382 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.6■■■■□ 3.77
CHST10-210ENST00000484382 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.55■■■■□ 3.76
CHST10-210ENST00000484382 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.48■■■■□ 3.75
CHST10-210ENST00000484382 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.4■■■■□ 3.74
CHST10-210ENST00000484382 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
CHST10-210ENST00000484382 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.12■■■■□ 3.69
CHST10-210ENST00000484382 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.12■■■■□ 3.69
CHST10-210ENST00000484382 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.73■■■■□ 3.63
CHST10-210ENST00000484382 SCRIBQ14160 1630 aa37.65■■■■□ 3.62
CHST10-210ENST00000484382 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.3■■■■□ 3.56
CHST10-210ENST00000484382 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
CHST10-210ENST00000484382 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.18■■■■□ 3.54
CHST10-210ENST00000484382 NCAPD3P42695 1498 aa36.07■■■■□ 3.37
CHST10-210ENST00000484382 SMARCA4P51532 1647 aa35.95■■■■□ 3.35
CHST10-210ENST00000484382 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.95■■■■□ 3.35
CHST10-210ENST00000484382 SMARCA2P51531 1590 aa35.93■■■■□ 3.34
CHST10-210ENST00000484382 HMGXB3Q12766 1538 aa35.83■■■■□ 3.33
CHST10-210ENST00000484382 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
CHST10-210ENST00000484382 ERCC6Q03468 1493 aa35.68■■■■□ 3.3
CHST10-210ENST00000484382 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CHST10-210ENST00000484382 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.61■■■■□ 3.29
CHST10-210ENST00000484382 CUX2O14529 1486 aa35.6■■■■□ 3.29
CHST10-210ENST00000484382 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.47■■■■□ 3.27
CHST10-210ENST00000484382 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.47■■■■□ 3.27
CHST10-210ENST00000484382 NESP48681 1621 aa35.41■■■■□ 3.26
CHST10-210ENST00000484382 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.3■■■■□ 3.24
CHST10-210ENST00000484382 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.1■■■■□ 3.21
CHST10-210ENST00000484382 WIZO95785 1651 aa35.09■■■■□ 3.21
CHST10-210ENST00000484382 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
CHST10-210ENST00000484382 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.05■■■■□ 3.2
CHST10-210ENST00000484382 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.99■■■■□ 3.19
CHST10-210ENST00000484382 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
CHST10-210ENST00000484382 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.75■■■■□ 3.15
CHST10-210ENST00000484382 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
CHST10-210ENST00000484382 WDR62O43379 1518 aa34.64■■■■□ 3.14
CHST10-210ENST00000484382 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.64■■■■□ 3.14
CHST10-210ENST00000484382 CFTRP13569 1480 aa34.58■■■■□ 3.13
CHST10-210ENST00000484382 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.58■■■■□ 3.13
CHST10-210ENST00000484382 PRDM2Q13029 1718 aa34.38■■■■□ 3.09
CHST10-210ENST00000484382 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.25■■■■□ 3.07
CHST10-210ENST00000484382 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CHST10-210ENST00000484382 OSCARQ8IYS5 282 aa34.01■■■■□ 3.03
CHST10-210ENST00000484382 ABCC8Q09428 1581 aa33.98■■■■□ 3.03
CHST10-210ENST00000484382 TRIM41Q8WV44 630 aa33.95■■■■□ 3.03
CHST10-210ENST00000484382 IFT140Q96RY7 1462 aa33.95■■■■□ 3.02
CHST10-210ENST00000484382 TOPBP1Q92547 1522 aa33.93■■■■□ 3.02
CHST10-210ENST00000484382 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.84■■■■□ 3.01
CHST10-210ENST00000484382 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
CHST10-210ENST00000484382 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
CHST10-210ENST00000484382 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
CHST10-210ENST00000484382 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
CHST10-210ENST00000484382 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.53■■■□□ 2.965e-7■■■■□ 19.7
CHST10-210ENST00000484382 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
CHST10-210ENST00000484382 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
CHST10-210ENST00000484382 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
CHST10-210ENST00000484382 SOGA1O94964 1423 aa33.46■■■□□ 2.95
CHST10-210ENST00000484382 CHD1O14646 1710 aa33.45■■■□□ 2.95
CHST10-210ENST00000484382 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.43■■■□□ 2.94
CHST10-210ENST00000484382 ARHGEF11O15085 1522 aa33.38■■■□□ 2.93
CHST10-210ENST00000484382 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.38■■■□□ 2.93
CHST10-210ENST00000484382 WDR97A6NE52 1622 aa33.38■■■□□ 2.93
CHST10-210ENST00000484382 FBLN2P98095 1184 aa33.37■■■□□ 2.93
CHST10-210ENST00000484382 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
CHST10-210ENST00000484382 CUX1P39880 1505 aa33.33■■■□□ 2.93
CHST10-210ENST00000484382 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
CHST10-210ENST00000484382 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.2■■■□□ 2.91
CHST10-210ENST00000484382 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
CHST10-210ENST00000484382 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.17■■■□□ 2.9
CHST10-210ENST00000484382 GRIN2BQ13224 1484 aa33.17■■■□□ 2.9
CHST10-210ENST00000484382 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
CHST10-210ENST00000484382 SYNJ1O43426 1573 aa33.09■■■□□ 2.89
CHST10-210ENST00000484382 PBRM1Q86U86 1689 aa33.07■■■□□ 2.89
CHST10-210ENST00000484382 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.05■■■□□ 2.88
CHST10-210ENST00000484382 SYNJ2O15056 1496 aa33.05■■■□□ 2.88
CHST10-210ENST00000484382 ARAP1Q96P48 1450 aa33.03■■■□□ 2.88
CHST10-210ENST00000484382 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.02■■■□□ 2.88
CHST10-210ENST00000484382 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.01■■■□□ 2.87
CHST10-210ENST00000484382 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.95■■■□□ 2.87
CHST10-210ENST00000484382 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.93■■■□□ 2.86
CHST10-210ENST00000484382 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.88■■■□□ 2.85
CHST10-210ENST00000484382 TOP2BQ02880 1626 aa32.88■■■□□ 2.85
CHST10-210ENST00000484382 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
CHST10-210ENST00000484382 GRIN2AQ12879 1464 aa32.72■■■□□ 2.83
CHST10-210ENST00000484382 ADAMTS12P58397 1594 aa32.7■■■□□ 2.82
CHST10-210ENST00000484382 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.65■■■□□ 2.82
CHST10-210ENST00000484382 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.64■■■□□ 2.82
CHST10-210ENST00000484382 NUP160Q12769 1436 aa32.6■■■□□ 2.81
CHST10-210ENST00000484382 CEP170Q5SW79 1584 aa32.57■■■□□ 2.8
CHST10-210ENST00000484382 SHROOM2Q13796 1616 aa32.46■■■□□ 2.79
CHST10-210ENST00000484382 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.44■■■□□ 2.78
CHST10-210ENST00000484382 JPH4Q96JJ6 628 aa32.32■■■□□ 2.76
CHST10-210ENST00000484382 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CHST10-210ENST00000484382 KIF27Q86VH2 1401 aa32.26■■■□□ 2.76
CHST10-210ENST00000484382 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.22■■■□□ 2.75
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