Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10AO00220 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms