Protein–RNA interactions for Protein: O00198

HRK, Activator of apoptosis harakiri, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRKO00198 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HRKO00198 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HRKO00198 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HRKO00198 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HRKO00198 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HRKO00198 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HRKO00198 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HRKO00198 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HRKO00198 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HRKO00198 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HRKO00198 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HRKO00198 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HRKO00198 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HRKO00198 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HRKO00198 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HRKO00198 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HRKO00198 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HRKO00198 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HRKO00198 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HRKO00198 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HRKO00198 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HRKO00198 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HRKO00198 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HRKO00198 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HRKO00198 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HRKO00198 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HRKO00198 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HRKO00198 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HRKO00198 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HRKO00198 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HRKO00198 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HRKO00198 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HRKO00198 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HRKO00198 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HRKO00198 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HRKO00198 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HRKO00198 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms