Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3BRM9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
H3BRM9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
H3BRM9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
H3BRM9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BRM9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BRM9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BRM9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BRM9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BRM9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BRM9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H3BRM9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H3BRM9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H3BRM9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms