Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8VRH5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8VRH5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8VRH5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8VRH5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8VRH5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8VRH5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8VRH5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8VRH5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8VRH5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8VRH5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8VRH5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8VRH5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms