Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB8E9PQR5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
NPIPB8E9PQR5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB8E9PQR5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB8E9PQR5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB8E9PQR5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms