Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.51■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP17L12C9JPN9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L12C9JPN9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms