Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
B4E1Z4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4E1Z4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4E1Z4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4E1Z4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4E1Z4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4E1Z4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4E1Z4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4E1Z4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
B4E1Z4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
B4E1Z4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
B4E1Z4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
B4E1Z4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
B4E1Z4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
B4E1Z4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
B4E1Z4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
B4E1Z4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
B4E1Z4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
B4E1Z4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
B4E1Z4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
B4E1Z4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
B4E1Z4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
B4E1Z4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
B4E1Z4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
B4E1Z4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
B4E1Z4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
B4E1Z4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
B4E1Z4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
B4E1Z4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
B4E1Z4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
B4E1Z4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
B4E1Z4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
B4E1Z4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
B4E1Z4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
B4E1Z4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
B4E1Z4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
B4E1Z4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
B4E1Z4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
B4E1Z4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
B4E1Z4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4E1Z4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
B4E1Z4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms