Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms