Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM23A6NLE4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM23A6NLE4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.7 ms