Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNX2A6NKB5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNX2A6NKB5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms