Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLCD2A6NGC4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TLCD2A6NGC4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms