Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF316A6NFI3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
ZNF316A6NFI3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms