Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F8A0AVK6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F8A0AVK6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms