Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0U1RQJ8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms