Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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