Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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