Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms