Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms