Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms