Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRPC4Q9UBN4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms