Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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