Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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