Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM248Q9NWD8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms