Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KIAA1549Q9HCM3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1617.9 ms