Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms