Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms