Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM4Q9C037 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms