Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP1Q9C000 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms