Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms