Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL25A1Q9BXS0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms