Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms