Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms