Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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