Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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