Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms