Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms