Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms