Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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