Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms