Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms